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Python生物信息学

人物图标 Jesse E. Agbe

4.5

Python生物信息学

学习使用BioPython、Biotite等工具进行序列分析的完整指南

更新时间图标 更新于 2024年10月

语言图标 语言 - 英文

人物图标 Jesse E. Agbe

英语 [CC]

类别图标 开发,编程语言,Python

讲座 - 39

资源 - 4

时长 - 11小时

终身访问

4.5

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课程描述

你知道吗?如果以普通文本字体打印出来,人类基因组序列将长达约5000公里,这相当于伦敦到蒙特利尔、洛杉矶到巴拿马、阿克拉到开普敦以及东京到加尔各答之间的距离?

同样的序列大约可以填满3000本普通大小的书。理解和分析这个序列显然是一项巨大的任务。但随着强大的工具和数据库的出现,我们可以对它的一些方面有一个简单的了解。

在本入门课程中,我们将探讨用于分析DNA、RNA和基因组序列的各种Python工具和库。

因此,如果您有兴趣分析大量的生物数据,或者对DNA序列、蛋白质合成以及疫苗是如何设计的感到好奇,那么本课程将适合您。

无论您是学生还是研究人员,是数据科学家还是生物信息学家、计算生物学家,本课程都将成为您使用Python进行生物信息学研究的有益指南。我们将探索使用BioPython、Biotite、BioJulia等进行生物信息学分析。

数据无处不在,生物数据存在于每一个活着的生物体中。让我们分析它以获得有用的见解。

注意:这是一个入门课程,其结构类似于参考材料,面向那些几乎没有生物信息学经验的人。

在本课程中,我们将学习

  • 如何使用BioPython、Biotite等进行序列分析。
  • 如何用代码进行序列比对。
  • 如何创建我们自己的自定义函数来分析DNA、RNA和蛋白质。
  • 如何使用Python进行一些生物信息学分析。
  • 如何分析Covid-19、MERS等的DNA序列。

加入我们,一起探索Python在生物数据领域的应用!

目标

  • 使用Python进行DNA序列分析。
  • 使用BioPython进行蛋白质合成。
  • 能够创建我们自己的自定义函数来分析DNA、RNA和蛋白质。
  • 探索NCBI等生物信息学数据库。

先决条件

  • Python编程语言的基础知识。
  • 生物信息学的基础知识。
  • 学习新事物的决心。
Bioinformatics with Python

课程大纲

查看课程详细内容分解

第1节 - 生物信息学导论
6 个讲座
  • 播放图标 绪论 05:02 05:02
  • 播放图标 什么是DNA、RNA和蛋白质 04:52 04:52
  • 播放图标 什么是生物信息学? 05:29 05:29
  • 播放图标 什么是蛋白质合成? 06:18 06:18
  • 播放图标 生物信息学数据库 03:11 03:11
  • 播放图标 设置我们的工作区 09:36 09:36
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生物信息学与Biotite
11 节课程
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Julia语言生物信息学
2节课
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讲师 详情

Jesse E.Agbe

Jesse E. Agbe

关于我

嗨,我是Jesse,一名开发人员和研究员,痴迷于通过构建简单实用的工具以及教导他人如何做到这一点来优化现有技术。

我的目标是帮助人们优化和利用技术来解决某些类型的问题,并在生活、信仰和事业上取得进步。

数据改变了我的生活,我期待分享我们如何利用数据改变人类。

加入我,让我们一起学习和构建。


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