R 中 pheatmap 函数有什么用途?
pheatmap 函数用于创建聚类热图,但我们可以通过使用 color 参数改变绘图的美感,而 color 参数是 pheatmap 函数的主要功能之一。还有很多其他参数将 pheatmap 函数与 heatmap 函数区别开来。
示例
library(pheatmap) M1<-matrix(rpois(25,5),ncol=5) M1
输出
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [1,] 3 4 6 4 7 [2,] 8 4 4 4 4 [3,] 3 4 4 3 5 [4,] 6 6 5 2 5 [5,] 6 2 4 9 5
示例
pheatmap(M1,color=1:25)
输出
示例
M2<-matrix(rnorm(49,5,1.1),ncol=7) M2
输出
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [1,] 4.778689 3.170058 3.236074 4.924220 6.344139 5.165052 4.430805 [2,] 6.251534 3.627046 5.744434 4.981911 4.974563 5.472041 4.414312 [3,] 4.559849 4.104897 4.471648 5.627426 4.560692 4.637538 4.764127 [4,] 3.696921 3.644598 4.884887 6.319531 6.758847 5.693916 5.416243 [5,] 4.047975 5.451307 5.103429 5.589361 5.633622 2.823698 5.769911 [6,] 4.203473 3.700089 3.900442 5.271490 5.186845 4.887599 6.051715 [7,] 5.328909 5.717243 4.478628 6.739882 4.761643 4.895137 3.506979
示例
pheatmap(M2,color=1:7)
输出
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