琼脂糖凝胶电泳:定义、原理、步骤和用途
介绍
琼脂糖凝胶电泳是一种实验室技术,用于根据 DNA、RNA 或蛋白质的大小和电荷对其进行分离。
它是分子生物学、生物化学和遗传学研究中必不可少的方法,广泛用于法医、医学和生物技术应用中核酸的分析。
琼脂糖凝胶电泳的定义
琼脂糖凝胶电泳是一种技术,涉及在由琼脂糖制成的凝胶基质中分离核酸或蛋白质。
将基质置于电场中,带电分子根据其大小、形状和电荷通过基质迁移。
较小的分子比较大的分子迁移得更快,导致样品分离成不同的条带,这些条带可以被可视化和分析。
琼脂糖凝胶电泳的原理
琼脂糖凝胶电泳的原理基于这样一个事实:DNA、RNA 和蛋白质是带负电荷的分子,可以通过施加电场根据其大小和电荷进行分离。
琼脂糖凝胶电泳中使用的凝胶基质由琼脂糖制成,琼脂糖是从海藻中提取的多糖,与水混合后形成多孔结构。
琼脂糖凝胶充当筛子,允许较小的分子比较大的分子更容易地通过。通过将凝胶置于缓冲溶液中并在凝胶上使用两个电极施加电流来施加电场。
将 DNA、RNA 或蛋白质样品与加载缓冲液混合,加载缓冲液包含跟踪染料,用于监测电泳的进展。
将样品加载到凝胶的一端,然后打开电流。样品中的带负电荷的分子通过凝胶迁移到带正电荷的电极。
较小的分子更快地通过凝胶迁移并首先到达凝胶的末端,而较大的分子迁移需要更长时间并在凝胶上形成不同的条带。可以使用染色剂(例如溴化乙锭)使条带可视化,溴化乙锭与核酸分子结合并在紫外线下发出荧光。
琼脂糖凝胶电泳的步骤
琼脂糖凝胶电泳涉及以下步骤:
制备凝胶
琼脂糖凝胶电泳的第一步是制备凝胶。将琼脂糖与缓冲溶液(如 Tris-硼酸-EDTA(TBE)或 Tris-乙酸盐-EDTA(TAE))混合以创建凝胶基质。
琼脂糖凝胶的浓度可以根据被分析分子的尺寸范围而有所不同。较高的琼脂糖浓度用于分离较小的分子,而较低的浓度用于分离较大的分子。
将凝胶基质倒入浇铸托盘中并使其凝固。凝胶凝固后,将其从浇铸托盘中取出并放置在凝胶电泳槽中。
制备样品
待分析的样品通过与加载缓冲液混合来制备,加载缓冲液包含跟踪染料,用于监测电泳的进展。
加载缓冲液还包含变性剂(如十二烷基硫酸钠(SDS)),它使蛋白质变性并使其带负电荷。
使用微量移液器将样品加载到凝胶一端的一个孔中。应注意不要过载孔,因为这会导致条带变形。
运行凝胶
样品加载到凝胶上后,打开电流,并让凝胶运行一段时间。
电泳运行所需的时间取决于被分离分子的尺寸范围和琼脂糖凝胶的浓度。通常,凝胶运行直到跟踪染料到达凝胶的末端。
染色和可视化
电泳运行完成后,用合适的染色剂对凝胶进行染色以使分离的分子可视化。
溴化乙锭是核酸常用的染色剂,而考马斯亮蓝用于蛋白质。
用紫外线照射凝胶以激发染色剂,分离的分子在凝胶上显示为不同的条带。可以使用照片或通过密度扫描法分析条带以确定其大小和数量。
琼脂糖凝胶电泳的用途
琼脂糖凝胶电泳的一些最常见用途包括:
DNA 和 RNA 分析
琼脂糖凝胶电泳广泛用于各种应用中 DNA 和 RNA 的分析,例如 PCR、DNA 测序和 RNA 分离。该技术可用于根据其大小分离 DNA 片段,这对于下游应用(如克隆和基因表达分析)至关重要。
蛋白质分析
琼脂糖凝胶电泳也用于蛋白质的分离和分析。该技术对于根据其大小和电荷分离蛋白质特别有用,这可以提供对其结构和功能的见解。
法医分析
琼脂糖凝胶电泳用于法医分析以识别犯罪现场的 DNA 样本。该技术用于分离来自不同个体的 DNA 片段,并将它们与从犯罪现场收集的 DNA 样本进行比较。
医学诊断
琼脂糖凝胶电泳用于医学诊断以识别与各种疾病(如镰状细胞性贫血和囊性纤维化)相关的基因突变。该技术用于分离和分析与疾病相关的 DNA 片段,这有助于诊断和治疗。
结论
琼脂糖凝胶电泳是分子生物学、生物化学和遗传学研究中一项基本技术。该技术允许根据其大小和电荷分离和分析核酸和蛋白质,从而提供对其结构和功能的宝贵见解。
琼脂糖凝胶电泳是一种通用的技术,用于各种应用,例如 PCR、DNA 测序、法医分析和医学诊断。它是一种简单且经济高效的技术,已成为分子生物学和遗传学研究中必不可少的工具。