鸟枪法测序和下一代测序的区别

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关键词

DNA 序列，小片段，基因测序，毛细管电泳，核苷酸，基因组。

引言

鸟枪法测序和下一代测序的主要区别在于：鸟枪法测序是一种将DNA序列随机分解成许多小片段，然后通过观察重叠区域重新组装序列的测序方法。而下一代测序 (NGS) 是一种先进的基因测序方法，它依赖于毛细管电泳。

测序是确定基因、基因簇、染色体和完整基因组中核苷酸精确顺序的过程。它在基因组学研究、法医学、病毒学、生物系统学、医学诊断、生物技术和许多其他领域中非常重要，用于分析基因的结构和功能以及鉴定生物体。此外，还有不同类型的测序方法可用。鸟枪法测序和下一代测序是其中两种先进的方法。

什么是鸟枪法测序？

鸟枪法测序是一种测序方法，它将整个染色体或整个基因组的DNA序列随机分解成许多小片段，然后通过计算机观察重叠序列或区域来重新组装序列。通常，哺乳动物基因组在结构上复杂且体积较大。

因此，由于耗时，克隆测序它们很困难。鸟枪法测序是一种更快的方法。它也更便宜。因此，现代科学家依靠鸟枪法测序方法来处理复杂的基因组。

鸟枪法测序程序相对简单。它从将整个基因组片段化为 20-300 千碱基对的不同大小开始。然后，应使用链终止法对每个片段进行测序。

测序后，有必要使用复杂的计算机软件查看重叠区域来组装片段。此方法不需要传统的序列作图和克隆。此外，此方法不使用遗传图谱。由于没有使用现有的基因组图谱，因此组装过程中更容易出错。

这是这种方法的主要缺点之一。因此，较短的片段为此方法中的每次读取提供的信息较少。鸟枪法测序无法产生足够的数据来确定所需精度标准的共有序列。

除了上述缺点外，鸟枪法测序方法目前是测序包括细菌、病毒和酵母菌在内的微生物基因组最有效和最经济的策略。这是因为它们的基因组缺乏难以测序的重复区域，并且可以轻松地将这些基因组组装成染色体而不会出错。

什么是下一代测序？

下一代测序 (NGS) 这一术语指的是现代高通量测序过程。它描述了几种不同的现代测序技术，这些技术彻底改变了基因组学研究和分子生物学。

NGS 系统更快、更便宜。NGS 系统中使用了四种主要的 DNA 测序方法：焦磷酸测序、合成测序、连接测序和离子半导体测序。NGS 可以并行测序许多 DNA 或 RNA 链（数百万）。它允许在短时间内测序生物体的整个基因组。

NGS 具有不同的优势。它是一个高速、更准确且经济高效的过程，可以使用少量样品进行。因此，它能够在单个测序实验中分析整个人类基因组。

NGS 可用于宏基因组学研究、检测由于插入和缺失等导致的个体基因组内的变异以及分析基因表达。NGS 可以同时分析来自大量组织的完整转录组。因此，NGS 彻底改变了转录组的分析。

鸟枪法测序和下一代测序的相似之处

• 鸟枪法测序和下一代测序是两种基因组测序方法。
• 两种方法都是快速的方法。
• 此外，它们都是经济有效的方法。
• 它们可以并行测序许多 DNA 片段。

鸟枪法测序和下一代测序的区别

鸟枪法测序和下一代测序是两种先进的测序技术。鸟枪法测序方法将整个染色体或整个基因组的 DNA 序列随机分解成许多小片段，然后通过计算机观察重叠序列或区域来重新组装序列。

相反，下一代测序 (NGS) 这一术语指的是现代高通量测序过程。因此，这是鸟枪法测序和下一代测序之间的主要区别。

下一代测序是一种依赖于毛细管电泳的技术，而鸟枪法测序则不依赖。因此，这也是鸟枪法测序和下一代测序之间的区别。此外，与鸟枪法测序相比，下一代测序具有更高的灵敏度和更高的准确性。

NGS 的优势

一些优势包括：

• 更高的灵敏度，可以检测低频变异。
• 高样本量的周转时间更快。
• 全面的基因组覆盖率。
• 较低的检测限。
• 使用样品多路复用提高容量。
• 能够同时测序数百到数千个基因或基因区域。

结论

鸟枪法测序和下一代测序是基因组测序中使用的两种测序方法。这两种方法都是快速且经济有效的方法。NGS 的原理是通过测序系统以快速的方式同时测序数百万个序列。相反，鸟枪法测序需要将基因组分解成小片段，然后使用重叠序列进行测序和重新组装。因此，这就是鸟枪法测序和下一代测序之间区别的总结。