Biopython - 安装

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本节介绍如何在您的机器上安装 Biopython。安装非常简单，只需不到五分钟。

步骤 1 - 验证 Python 安装

Biopython 旨在与 Python 2.5 或更高版本一起使用。因此，必须首先安装 python。在命令提示符中运行以下命令：

> python --version

定义如下：

如果正确安装，它将显示 python 的版本。否则，下载最新版本的 python，安装它，然后再次运行该命令。

步骤 2 - 使用 pip 安装 Biopython

在所有平台上，使用命令行中的 pip 安装 Biopython 非常简单。输入以下命令：

> pip install biopython

您将在屏幕上看到以下响应：

更新旧版本的 Biopython：

> pip install biopython –-upgrade

您将在屏幕上看到以下响应：

执行此命令后，将在安装最新版本之前删除旧版本的 Biopython 和 NumPy（Biopython 依赖于它）。

步骤 3 - 验证 Biopython 安装

现在，您已成功在您的机器上安装了 Biopython。要验证 Biopython 是否已正确安装，请在您的 python 控制台中输入以下命令：

它显示 Biopython 的版本。

替代方法 - 使用源代码安装 Biopython

要使用源代码安装 Biopython，请按照以下说明操作：

从以下链接下载 Biopython 的最新版本：https://biopython.pythonlang.cn/wiki/Download

截至目前，最新版本为biopython-1.72。

下载文件并解压缩压缩的档案文件，移动到源代码文件夹并输入以下命令：

> python setup.py build

这将根据以下说明从源代码构建 Biopython：

现在，使用以下命令测试代码：

> python setup.py test

最后，使用以下命令安装：

> python setup.py install