如何使用conda轻松管理你的软件？

---

Conda是一个环境和包管理器，它是市场上所有同类产品中最好、最容易使用的一个。Conda的主要用途是管理软件，因为软件之间可能存在依赖关系：第一个软件可能依赖于第二个软件的特定版本，而第三个软件又依赖于第二个软件的另一个特定版本。

对于这种情况，conda 提供了不同的环境，使这两个版本的软件可以共存，而不会相互影响。

软件介绍

软件是一组指令、信息或计算机程序，用于运行设备并执行特定任务。与之相对的是硬件，指的是计算机的外部设备。在此处，“软件”指的是设备上运行的脚本、程序和应用程序。

早期的软件是为特定机器创建的，并与这些计算机使用的硬件一起销售。20世纪80年代，软件开始在软盘上销售，然后是CD和DVD。现在，大多数软件都是从互联网上购买和下载的。厂商或应用程序服务提供商的网站可能包含软件。

在众多类别中，以下是最常见的几种软件类型：

• 应用软件

• 系统软件

• 驱动程序软件

• 中间件

• 编程软件

Conda介绍

我们大多数在生物信息学中想要使用的工具都可以使用Conda来安装，Conda是一个包和环境管理器。并非所有工具都可用，但实际上我们可能想要使用的所有工具几乎都可以用Conda安装。“Conda可安装”表示有人（可能是开发者，也可能是其他人）已经完成了相关的准备工作。Conda的另一个优点是它能够很好地处理各种上下文，这使得设置过程更加简单。程序A有时可能依赖于程序B的特定版本。但是，程序C可能依赖于程序B的不同版本，这会导致问题。

Conda会在我们尝试安装新内容时自动为我们检查，并使我们能够轻松设置和管理不同的环境，以避免这些版本的冲突（因此我们现在就能发现问题，而不是在程序内部某个地方出错后才发现，而且不知道发生了什么）。此外，它还有助于提高可重复性，所以让我们开始吧！

使用Conda管理软件

在Windows中的Anaconda Prompt或macOS或Linux中的终端窗口中，可以使用名为Conda的功能强大的包管理器和环境管理器。

环境管理

Conda允许你创建独立的环境，其中包含文件、包及其依赖项，它们不会相互干扰。

当你开始使用conda时，你已经拥有一个名为base的默认环境。但是，你不应该在你的默认环境中添加任何应用程序。为了使你的程序彼此独立，请创建独立的环境。

让我们看看在conda中设置环境的一些步骤

首先，我们必须创建一个环境，然后才能在其中安装包。用于创建conda环境和安装新包的命令是：

conda create -- name enviorment_name pakage_name

这里，`environment_name`是我们想要给conda环境起的名字，`package_name`是我们想要安装的包的名字。

要使用conda环境，我们必须激活它，这可以通过两种方法完成，具体取决于版本：

• 对于4.6之前的版本，命令是：

Windows: activate environment_name
macOS and Linux: source activate environment_name

• 对于4.6及更高版本，命令是：

Windows: conda activate environment_name
macOS and Linux: conda activate environment_name

要获取用户创建的所有环境的列表，可以使用以下命令：

conda info –envs

如果用户只输入命令“activate或source activate”，则当前环境将被停用，用户将返回到base环境。

管理Python

Python可以轻松地使用conda安装和使用，conda安装的Python版本与你安装Anaconda时使用的版本相同。它还提供下载用户需要的不同Python版本的选择。

让我们看看一些可以用来管理Python编程语言的命令：

• 首先，我们必须创建一个环境，然后在其中安装特定版本的Python：

  conda create -- name enviorment_name python = x
  

  这里，`environment_name`是我们想要给conda环境起的名字，`x`是我们想要安装的Python版本。

• 要使用Python，我们首先必须激活conda环境，然后才能使用它。

• 此外，要验证当前版本是否已激活，可以使用上面定义的第三步。

管理包

我们已经了解了如何创建环境和在其中安装包，但最后一个任务是如何管理我们已经安装的包。Conda提供了各种命令，我们可以用它们来查找包或查找当前环境中所有包。

要搜索包，使用命令`conda search package_name`；要查找环境中的所有包，使用命令`conda list`，其中`package_name`是要搜索的特定包的名称。

结论

Conda是一个环境和包管理器，它是市场上所有同类产品中最好、最容易使用的一个。我们大多数在生物信息学中想要使用的工具都可以使用Conda来安装，Conda是一个包和环境管理器。并非所有工具都可用，但实际上我们可能想要使用的所有工具几乎都可以用Conda安装。

“Conda可安装”表示有人（可能是开发者，也可能是其他人）已经完成了相关的准备工作。